Από τις 17/10/2008 ισχύει υπουργική απόφαση που χαρακτηρίζει εθνικό πάρκο με περιφεριακή ζώνη τους υγροβιότοπους Δέλτα Νέστου αλλά και τις λίμνες Βιστωνίδα και Ισμαρίδα και την ευρύτερη περιοχή τους. Ενώ εκ πρώτης όψεως φαίνεται σαν κάτι θετικό αυτή η απόφαση και για τη δικαιολόγησή της επικαλείται ως σκοπός η προστασία της φύσης και του τοπίου, εντούτοις περιλαμβάνει ρυθμίσεις που θίγουν βάναυσα και υποβαθμίζουν εξαιρετικά ευαίσθητες περιοχές που συγκαταλέγονται στους προστατευόμενους υγρότοπους και οικότοπους.
Επίσης η συγκεκριμένη απόφαση προβλέπει επέκταση οικισμών και περαιτέρω δόμηση, καθώς και τουριστικές εγκαταστάσεις που θα επηρεάσουν αρνητικά τη λίμνη και το Δέλτα του Νέστου καταστρέφοντας ενδιαιτήματα άγριων πουλιών και υποβαθμίζοντας έναν εξαιρετικού ενδιαφέροντος οικότοπο. Τέλος προβλέπεται και βιομηχανική περιοχή όπου επιτρέπονται μονάδες υψηλής όχλησης, γεγονός που θα αποτελέσει μόνιμη αιτία υποβάθμισης της περιοχής.